Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRMP28827 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
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