Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA5P20719 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms