Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNB3P16520 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNB3P16520 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms