Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMC1P11047 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMC1P11047 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms