Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf89P0DMQ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms