Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms