Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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