Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms