Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TSPAN13O95857 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms