Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL18O94889 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms