Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC45O75419 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC45O75419 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC45O75419 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC45O75419 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms