Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN2BO60939 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCN2BO60939 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms