Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA3O43365 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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HOXA3O43365 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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HOXA3O43365 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA3O43365 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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HOXA3O43365 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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HOXA3O43365 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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HOXA3O43365 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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HOXA3O43365 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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