Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTIFO43310 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTIFO43310 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTIFO43310 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTIFO43310 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTIFO43310 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTIFO43310 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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