Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPAA1O43292 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPAA1O43292 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms