Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIAH2O43255 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms