Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN8O00124 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms