Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3KR12 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3KR12 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3KR12 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
J3KR12 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms