Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCER2I3L3R5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCER2I3L3R5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms