Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AUP1Q9Y679 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AUP1Q9Y679 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms