Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CHTOPQ9Y3Y2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms