Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENND2AQ9ULE3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms