Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ERG28Q9UKR5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms