Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REV1Q9UBZ9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms