Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPARGC1AQ9UBK2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms