Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMG20BQ9P0W2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms