Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms