Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNNM1Q9NRU3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms