Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPAG4Q9NPE6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms