Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms