Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RASSF4Q9H2L5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RASSF4Q9H2L5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASSF4Q9H2L5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RASSF4Q9H2L5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms