Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms