Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BHLHE41Q9C0J9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms