Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PACSIN1Q9BY11 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN1Q9BY11 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms