Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGLYRP3Q96LB9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms