Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPSB1Q96BD6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPSB1Q96BD6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms