Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX21Q969T3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms