Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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GTF3C6Q969F1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF3C6Q969F1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3C6Q969F1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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