Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNPO1Q92973 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms