Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD50Q92878 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD50Q92878 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms