Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC191Q8NCU4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC191Q8NCU4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms