Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NECAB1Q8N987 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NECAB1Q8N987 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms