Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms