Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKAP1Q86WV1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms