Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM43BQ6ZT52 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms