Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATL3Q6DD88 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL3Q6DD88 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms