Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF123Q5XPI4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms