Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYOM3Q5VTT5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYOM3Q5VTT5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms