Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM16Q2WEN9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CEACAM16Q2WEN9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms