Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT16Q17RD7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT16Q17RD7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms